1 生物樣品穩(wěn)定儀
在蛋白質(zhì)組研究中,要得到準(zhǔn)確可靠的結(jié)果,很大程度上取決于樣品的前處理方法。保持樣品的穩(wěn)定性,即樣品是否反映目標(biāo)蛋白質(zhì)在活體內(nèi)的原始狀態(tài)則尤為重要。一旦樣品從機(jī)體分離,調(diào)控平衡被打破,對(duì)于某些蛋白質(zhì)或多肽,離體降解是一個(gè)很快速的過程。降解導(dǎo)致蛋白質(zhì)的種類、含量和修飾快速變化,使得檢測(cè)到的部分蛋白質(zhì)或肽段實(shí)際上是高豐度蛋白質(zhì)的降解產(chǎn)生的片段,而不是樣品的原始蛋白質(zhì)。
在細(xì)胞和組織表達(dá)的蛋白質(zhì)組中,發(fā)揮重要生理功能、最具研究意義和價(jià)值的蛋白質(zhì)通常是一些含量很小、穩(wěn)定性差的低豐度蛋白質(zhì)或多肽。隨著蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展,檢測(cè)方法的靈敏度越來越高,也對(duì)樣品前處理方法提出了更高的要求,如何在處理樣品過程中保留這些蛋白質(zhì)或多肽就變得越來越重要。
因此采用一種快速、有效的樣品穩(wěn)定方法,盡量縮短樣品采集與穩(wěn)定之間的間隔時(shí)間并將樣品前處理過程標(biāo)準(zhǔn)化,對(duì)于蛋白質(zhì)研究具有重要意義。高質(zhì)量的樣品前處理有利于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù),進(jìn)而增強(qiáng)分析結(jié)果的可靠性和可比性。
Stabilizor系統(tǒng)是瑞典Denator公司的專利生物樣品穩(wěn)定技術(shù)。該系統(tǒng)包含Stabilizor T1主機(jī)和Maintainor樣品卡,用于解決蛋白質(zhì)離體降解的難題。Stabilizor系統(tǒng)能快速、均勻、準(zhǔn)確的將熱量傳遞給樣品,破壞蛋白質(zhì)中的氫鍵,保留氨基酸鏈的共價(jià)肽鍵,即破壞蛋白質(zhì)的二級(jí)及以上結(jié)構(gòu),保留一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性。這種不可逆的失活效應(yīng)將樣品中的各種酶類失活,從而將蛋白質(zhì)離體降解的程度降到最低。處理過程中無需添加輔助抑制試劑,也將后期分析的干擾因素降到了最低。
使用Stabilizor系統(tǒng)無需添加輔助抑制試劑即可永久性的去除蛋白酶和磷酸酶的活性,防止蛋白質(zhì)降解發(fā)生。降低蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性,減少高豐度蛋白質(zhì)降解片段的干擾,增加分析和發(fā)現(xiàn)具有重要價(jià)值的蛋白質(zhì)/多肽生物標(biāo)記物的可能性。Stabilizor處理樣品具有的穩(wěn)定性、標(biāo)準(zhǔn)化和可追溯性,更易得到高質(zhì)量的分析數(shù)據(jù)。
液氮速凍結(jié)合酶抑制劑是目前廣泛使用的阻止樣品降解的標(biāo)準(zhǔn)方法。但這種方法會(huì)破壞細(xì)胞膜和細(xì)胞結(jié)構(gòu),使得樣品融化后,降解和修飾蛋白質(zhì)的酶分布得更廣泛,導(dǎo)致更多蛋白質(zhì)或其修飾形式發(fā)生改變。而且這種方法具有可逆性和選擇性,無法全面的阻止樣品中酶類的活性,添加的試劑還會(huì)干擾后期樣品分析,部分試劑具有一定毒性。
使用Stabilizor系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì):
是一種純物理的樣品穩(wěn)定方法,不需使用干擾后期分析的酶抑制劑
處理時(shí)間短,一般在一分鐘以內(nèi)即可將樣品中的各種酶類失活
有利于保留樣品在活體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化和其它翻譯后修飾的真實(shí)狀態(tài),保留不穩(wěn)定、易降解的低豐度蛋白質(zhì)
避免了樣品中低豐度蛋白質(zhì)或多肽受高豐度蛋白質(zhì)降解片段的干擾,有助于發(fā)現(xiàn)新的蛋白質(zhì)、多肽以及它們的修飾形式
永久性的去除蛋白酶和磷酸酶的活性,樣品經(jīng)穩(wěn)定后,即可在常溫下進(jìn)行制備操作,無需擔(dān)心酶對(duì)蛋白質(zhì)、多肽的降解或改變它們的修飾形式
降低蛋白質(zhì)組的復(fù)雜程度,縮小動(dòng)態(tài)范圍,增加分析和發(fā)現(xiàn)具有重要價(jià)值的蛋白質(zhì)或多肽生物標(biāo)記物的可能性
使用方便,在采樣的同時(shí)即可穩(wěn)定樣品,縮短樣品離體降解的時(shí)間
樣品采集和儲(chǔ)存的過程高度標(biāo)準(zhǔn)化,使分析結(jié)果更加可靠,數(shù)據(jù)更具可比性,便于進(jìn)行比較蛋白質(zhì)組研究
使用MALDI-MSI檢測(cè)目標(biāo)蛋白質(zhì)或多肽,Stabilizor是目前最為有效的樣品穩(wěn)定方法
技術(shù)參數(shù):
Stabilizor T1主機(jī)
4.3英寸彩色觸摸顯示屏
對(duì)樣品卡施加真空壓力范圍:10—100mbar
噪音:低于45分貝
樣品尺寸測(cè)量激光分級(jí):CLASS 1藍(lán)色激光
內(nèi)置處理器:1 GHz×86,內(nèi)存為1GB
操作系統(tǒng):Linux開源軟件
三個(gè)USB接口
外部尺寸(L×W×H):465×306×143mm
凈重: 6.7kg
功率:最高為350瓦,正常使用為70瓦,待機(jī)為20瓦
電源:100-240V/50-60Hz
使用環(huán)境溫度:10—40℃
使用環(huán)境最大相對(duì)濕度:80%(無凝結(jié))
Maintainor樣品卡
外部尺寸(L×W×H):85×54×2mm
樣品腔尺寸:高7mm,直徑33mm
使用環(huán)境最大相對(duì)濕度:85%(無凝結(jié))
材質(zhì):PC,帶特氟龍涂層
適用溫度:-80—100 ℃