采用經(jīng)典的陽離子交換色譜分離、茚三酮柱后衍生法，對蛋白質(zhì)水解液及各種游離氨基酸的組分含量進行分析。儀器基本結(jié)構(gòu)同普通HPLC相似，但針對氨基酸分析進行了細節(jié)優(yōu)化（例如氮氣保護、惰性管路、在線脫氣、洗脫梯度及柱溫梯度控制等等）
  通常細分為兩種系統(tǒng)：蛋白水解分析系統(tǒng)（鈉鹽系統(tǒng)）和游離氨基酸分析系統(tǒng)（鋰鹽系統(tǒng)），利用不同濃度和pH值的檸檬酸鈉或檸檬酸鋰進行梯度洗脫。其中鈉鹽系統(tǒng)一次最多分析約25種氨基酸，速度較快，基線平直度好；鋰鹽系統(tǒng)一次最多分析約50種氨基酸，速度較慢，基線一般不如鈉鹽系統(tǒng)好。
  分析效果：從目前已知的氨基酸分析方法比較來看，除靈敏度（即最低檢測限）比HPLC柱前衍生方法稍低以外（HPLC：<0.5pmol；氨基酸分析儀：<10pmol)，其他如分離度、重現(xiàn)性、操作簡便性、運行成本等方面，都優(yōu)于其他分析。

技術參數(shù)
標準配置： 8個300l UV 塑料比色杯，池架和電源線 
波長范圍 ：198至1000nm 
分辨率/精度： 1nm /±2nm 
帶 寬 ：5nm typical@270nm 
范 圍 ：0 to 199%T
-3.00 到1.999A
-300 to 9999Conc 
分辨率 ：0.1%T, 0.001A,0.001,0.01,0.1,1Conc 
濃度單位 ：ppm, mg/l, g/l, M, %, blank, mg/ml, g/ml, ng/ml 
光源 氙燈 
雜 散 光 ：<0.001A@ 0A @ 400nm 
測光穩(wěn)定性 ：30分鐘后<0.002A/小時 
因子范圍 ：0到999.9 / 1000到9999 
讀 出： 圖形模式LCD顯示 
輸 出 ：模擬輸出(0 to 1.999V d.c.)