電源提供直流電，在電泳槽中產(chǎn)生電場(chǎng)，驅(qū)動(dòng)帶電分子的遷移。電泳槽是電泳系統(tǒng)的核心部分，根據(jù)電泳的原理，電泳支持物都是放在兩個(gè)緩沖液之間，電場(chǎng)通過電泳支持物連接兩個(gè)緩沖液，不同電泳采用不同的電泳槽.常用的電泳槽有：
1、垂直板式電泳：制膠和電泳不在電泳管中，而是在塊垂直放置的平行玻璃板中間，常用于聚丙烯酰胺凝膠電泳中蛋白質(zhì)的分離和對(duì)少量核酸及蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行垂直電泳。電泳槽中間是夾在一起的兩塊玻璃板，玻璃板兩邊由塑料條隔開，在玻璃平板中間制備電泳凝膠，凝膠的大小通常是12cm～14 cm，厚度為1mm～2 mm，制膠時(shí)在凝膠溶液中放一個(gè)塑料梳子，在膠聚合后移去，形成上樣品的凹槽。垂直電泳槽也有不同型號(hào)，一般分為小型，中型和大型，差別是凝膠板規(guī)格大小和試樣格齒數(shù)及厚度。
2、水平式電泳：凝膠鋪在水平的玻璃或塑料板上，用一薄層濕濾紙連接凝膠和電泳緩沖液，或?qū)⒛z直接浸入緩沖液中。由于pH值的改變會(huì)引起帶電分子電荷的改變，進(jìn)而影響其電泳遷移的速度，所以電泳過程應(yīng)在適當(dāng)?shù)木彌_液中進(jìn)行的，緩沖液可以保持待分離物的帶電性質(zhì)的穩(wěn)定。水平式電泳用于對(duì)少量或大批量核酸（DNA或RNA）進(jìn)行瓊脂糖電泳。水平電泳槽有不同型號(hào)，一般分為迷你型，小號(hào)，中號(hào)和大號(hào)，主要差別同樣是凝膠板規(guī)格大小和試樣格齒數(shù)及厚度。迷你型的試樣格齒數(shù)一般有十齒左右，小號(hào)通常6～15齒不等，中號(hào)大多三十幾齒，大號(hào)可達(dá)48齒。
3、等電聚焦多用途電泳槽：適合于分離分子量相近而等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)組分
4、轉(zhuǎn)移電泳槽： 用來對(duì)少量核酸及蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)移電泳的裝置。分為槽式轉(zhuǎn)印，半干轉(zhuǎn)印，微量過濾和篩選，真空轉(zhuǎn)印。槽式轉(zhuǎn)印系統(tǒng)可理想地用于多數(shù)常規(guī)蛋白研究，可靈活選擇電壓設(shè)置，轉(zhuǎn)印時(shí)間和冷卻方法。半干轉(zhuǎn)印槽無需緩沖液槽或轉(zhuǎn)印夾就能實(shí)現(xiàn)快速，有效，經(jīng)濟(jì)的轉(zhuǎn)印，最適于中等分子量大小的蛋白（10-100KD），也能從瓊脂糖凝膠上轉(zhuǎn)印DNA和RNA。微量過濾（或斑點(diǎn)印跡設(shè)備）用于新印跡分析中確定工作條件，或其他不要求凝膠電泳分辨率的應(yīng)用。適于蛋白和核酸的雜交。真空轉(zhuǎn)印能快速而有效的把DNA或RNA從瓊脂糖凝膠轉(zhuǎn)到尼龍膜?？傊?，您可以結(jié)合自身需求選擇合適的電泳槽儀器。
例如：瓊脂糖凝膠電泳分為垂直及水平型兩種。其中水平型可制備低濃度瓊脂糖凝膠，而且制膠與加樣都比較方便，故應(yīng)用也相對(duì)比較廣泛些。